Evidentemente puedes pintarlo como te de la real gana, pero si tu capítulo sigue el Codex Astartes, _debe_ ir en azul. Las normas están para cumplirlas, que las ha escrito Mr. Roboute Guilliman!!
Los lobos llevan sus sacerdotes rúnicos como quieren porque no siguen el Codex Astartes.
Los caballeros grises no tienen bibliotecarios por eso no cambian el color de su armadura.
Sólo hay que consultar el codex marines espaciales, el actual no lo se, pero en los anteriores lo ponía bien clarito. Es que está especificado hasta los colores que tiene cada compañía y las insignias de pelotones. Tecnomarines de rojo, apotecarios de blanco, capellanes de negro....
Puedes consultar la organización aquí:
http://wh40k.lexicanum.com/wiki/Codex_Astartes